龙岩市交通运输综合执法支队内设机构10个：综合科、政策法规科、财务审计科、执法一大队、执法二大队、执法三大队、执法四大队、执法五大队、执法六大队、执法七大队，直属机构1个：龙岩市交通运输综合执法支队新罗直属大队，直管单位8个：新罗坂寮超限运输检测站、新罗铁山超限运输检测站、永定古洋超限运输检测站、上杭郭车超限运输检测站、武平十方超限运输检测站、长汀七里超限运输检测站、连城文亨超限运输检测站、漳平溪口超限运输检测站，代管单位1个：龙岩市交通工程试验检测中心。

　　(一)综合科

　　综合协调行政管理工作，检查督促重大事项的落实;组织起草全市交通综合行政执法工作重要报告、综合性文件;负责做好机关各部门的协调工作、组织重要会议;负责单位综合信息宣传、报道及政务公开工作;负责文秘、机要、保密、信访、档案、计算机和总务、财产、房管、车管、接待等行政后勤管理工作;负责人事劳动工资、教育培训、计划生育和离退休人员的管理与服务工作;负责机关效能建设工作;负责科技和信息化工作;负责交通执法专业化装备的规划规范、资源配置和日常管理;开展本行业节能减排、生态环保等工作;负责党建、党风廉政建设、精神文明建设、思想政治建设和群团工作。

　　(二)政策法规科

　　负责贯彻、执行交通行政执法有关法律法规、规章和政策;开展交通运输综合行政执法政策研究，起草规范性文件并组织实施;指导交通运输综合执法系统法制建设和队伍建设;组织、指导交通运输综合执法监督检查，承办行政复议、诉松工作;负责交通运输综合执法系统法制宣传教育工作，协助做好全市交通运输综合行政执法人员的证件管理工作。

　　(三)财务审计科

　　部负责组织日常会计核算和档案工作;制定年度部门预算并组织实施;负责交通运输综合行政执法罚没款项的财务收支管理工作;负责固定资产投资、维修(维护)、效益评审工作;负责国有资产的监督管理及保障国有资产的安全完整工作;协助做好物资的政府招标采购工作;负责支队内部审计，对支队财务收支、专项资金征收、使用及管理进行审计。

　　(四)执法一大队

　　负责组织指导和开展道路运政执法工作;依法实施对道路客运、货运、公交、出租车、汽车租赁和轨道交通行业的监督检查，并查处违法违规行为，维护运输市场良好秩序;

　　依法对全市机动车维修、机动车驾驶员培训、运输从业人员培训、运输站场等客货运输中介服务业的监督检查，受理群众举报并依法查处非法营运等违法违规行为;负责紧急运输的秩序维护，负责春运等重要节假日临时运输检查站点工作。

　　(五)执法二大队

　　负责组织指导和开展水路运输市场管理的行政执法工作;负责水路运输质量管理工作，依法查处内河“三无”船舶，对未持有船舶登记证书、检验证书和船员适任证书等行为予以处罚;负责内河水上交通秩序，打击非客运船舶非法载客行为，保障船舶排筏航行、停泊和作业安全;负责渔船的监督管理;受理群众举报和水路运输市场违法违规案件的立案、调查、处理及反馈工作;负责查处船舶影响内河水域环境行为;负责水上水下施工许可监督检查;组织开展港口、岸线、水路运输、航道等综合行政执法活动，纠正并查处违法行为。

　　(六)执法三大队

　　负责组织指导和开展公路路政执法工作;承担公路及附属设施的监督和检查职责，保护公路路产路权;负责公路巡查工作，制止、纠正污染公路和破坏、侵占公路及其公路设施的行为，及时进行立案查处、追偿等工作;负责公路两侧建筑红线控制区的监督管理;依法对车辆超限运输进行监督管理;负责紧急运输、重大自然灾害应急处置的保畅通工作。

　　(七)执法四大队

　　负责全市交通建设工程监督项目施工中的质量监督;负责全市交通建设工程监督项目施工中的安全生产监管;负责全市交通建设工程监督项目的质量评定。

　　(八)执法五大队

　　负责全市道路客运站(点)、道路货运(含危险货物)站(场)、火车站、机场等客货运运输集中、集散地相关交通运输具体执法工作的指导协助工作;负责对汽车站、火车站等交通枢纽区域客运秩序实施行政执法监督、检查等:负责对汽车站、火车站等场站客运市场管理，维护交通运输秩序，保障经营者和旅客的合法权益;负责对区域内运营出租车车容、无故拒载、拼客、不打计价器、中断服务等违规违法行为进行查处;负责打击和查处区域内及周边其他非法营运车辆;负责涉及客运出租、公共汽车行业管理、服务及违规经营行为的举报、投诉的受理和查处工作。建立应急处理机制，对执法过程的突发问题进行妥善处理，做好相应安全管理工作，防止各类安全事故发生;对安全隐患做到有效处理，及时上报;与区域内相关部门建立良好的工作联系，有效开展联合执法行动。

　　(九)执法六大队

　　组织落实我市交通运输综合执法安全生产和应急工作方针、政策及各项规定，并监督检查相关工作的执行情况;组织开展执法系统季节性安全生产和应急管理工作、安全生产的检查和专项督查;依法参与交通运输综合行政执法相关的应急处置和安全事故的调查处理，并会同相关部门督查事故处理及责任追究落实情况;指导交通运输综合执法系统综合治理和平安建设工作;负责安全、应急信息统计汇总、分析等工作。

　　(十)执法七大队

　　负责全市重大、重点交通运输具体执法工作的指导协助工作;承担上级决定或单位指定的全市范围内交通运输重点执法监管职责;组织开展全市重大和辖区内跨区域的交通运输执法活动;在全市范围内负责组织指导重大、复杂案件的查处工作，开展重大、典型案件的查处工作，按规定报送或移交违法案件;具体负责社会投诉举报和上级及相关部门交办、转办案件的调查处理;负责交通综合行政执法违法案件的档案管理工作;负责对交通运输综合行政执法违法案件的立案、核实、处理和信息公开等。